Prokletije čine geografski predeo sa najviše vodenih resursa u Albaniji. Njihova južna granica, reka Drim, najveća je reka u državi i protiče dužinom od 335 kilometara dok je površina 19,582 km2 sa preko 1.5 miliona stanovnika. Veliki broj planinskih reka koje se sa Prokletija spuštaju u Drim, kao što su Šalja, Valbona, Kiri, itd. kao i reka Gashi, nalaze se na UNESCO listi prirodnog nasleđa. Sve ove reke se slivaju u Drim. Čitavu ovu rečnu mrežu Prokletija dodatno krasi i nekoliko drugih reka kao što su Cijevna, Merituri, Grenčar, i stotine potoka i brzaka koji sakupljaju vodu od snega koji se topi sa vekovima starih glečera na planinskim vrhovima. Prokletije su region sa najvećom stopom padavina u Albaniji, mahom od snega čija debljina može biti i preko 6 metara. Na Prokletijama postoje i glečerska jezera kao što je Jezerce, Pećko jezero, Dash, Shtraza, itd. Osim toga, na Prokletijama ima na hiljade izvora i desetine vodopada. Temperatura ove velike količine vode koja nastane od otopljenog snega ili sa izvora je oko 4-8 C i svuda je dostupna na Prokletijama.
